| 1540 | 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | 聖誕319
祖滅259 | 1・3・6・9・10・12 | 1・13 | 広蔵院日辰、本門八品同異抄1巻を著す(奥書) |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | 2・8 | 備後水呑妙顕寺13世威音院重源寂(過帳) |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | 2・21 | 岐阜法華寺3世行智院日要寂(過帳)、一説には29日 |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | 3・10 | 松永久秀、京都本国寺の三光堂を造立す(圀譜) |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | 5・24 | 遠江中村満勝寺5世心住院日要寂(過帳) |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | 7・29 | 法華宗徒、叡山の為に訴られ数輩頸を刎らる(摧邪・浄譜) |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | 9・18 | 丹後網野本覚寺開基檀那河田金右衛門、法号山渓院宗沢日傳居士卒(過帳) |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | 10・14 | 武蔵蒲田妙典寺大檀那六郷領主上杉憲行、里見氏と戦い討死す、法号清天院朗忠日椙(過帳) |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | 11・ | 上旬より明年3月中旬まで、京都本隆寺日諦、越前国一乗ヶ谷に於て涌出品を講ず(奥書) |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | 11・16 | 広蔵院日辰、宗要集1巻を著す(奥書) |
| 天文9年 | 元中9年 | 庚子 | | | | ・ | 相州小田原の外郎宇野定治日蓮宗に帰依し、同地に光浄山玉伝寺を創して身延13世日傳を開山とす(外郎文書) |
| 1541 | 天文10年 | 元中9年 | 辛丑 | | 聖誕320
祖滅260 | 1・2・4・7・10・11 | 2・29 | 伊豆韮山本立寺2世円乗院日穀寂(過帳) |
| 天文10年 | 元中9年 | 辛丑 | | | | 5・13 | 越前八品派本妙寺4世日喜寂(過帳) |
| 天文10年 | 元中9年 | 辛丑 | | | | 8・8 | 京都妙満寺22世法雲院日長寂(満歴) |
| 天文10年 | 元中9年 | 辛丑 | | | | 10・15 | 越前今宿妙勧寺15世恵光院日詮寂(過帳) |
| 天文10年 | 元中9年 | 辛丑 | | | | 10・27 | 三河岡崎善立寺2世大法院日漸寂(過帳) |
| 天文10年 | 元中9年 | 辛丑 | | | | 10・27 | 京都妙伝寺3世日肝、再び寺を西洞院四条下ルへ移し堂宇を建立す(伝誌) |
| 1542 | 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | 聖誕321
祖滅261 | 1・2・③・5・7・10・11 | 1・24 | 京都本隆寺3世・越前平等会寺7世顕本院日唱、平等会寺に於て寂85(霊記・伝録・真綱・過帳) |
| 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | | | 1・27 | 京都妙覚寺16世宝蔵院日顒寂(覚歴・霊記) |
| 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | | | 2・5 | 越前平等会寺6世日存寂(過帳) |
| 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | | | 3・29 | 九州千葉喜胤没(光譜) |
| 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | | | 4・ | 陣門越後本成寺菩提心院日覺、後奈良天皇の勅を奉じ一七日(7日間)紫宸殿に於て法華経を講ず、その功に依り大僧正と為る(陣系) |
| 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | | | 6・12 | 駿河守護今川義元、同国大石寺に禁制を掲ぐ(石書) |
| 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | | | 9・6 | 京都妙蓮寺学頭4世常住院日亮寂79(蓮頭) |
| 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | | | 11・14 | 後奈良天皇より右中弁晴秀の名を以て、法華宗21ヶ寺の帰洛・本地管領再興の綸旨を賜わる(霊記冠) |
| 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | | | 11・20 | 京都本国寺日助、堺の成就寺より帰洛し、大徳寺の傍に庵を結び諸人を勧化す(圀記) |
| 天文11年 | 元中9年 | 壬寅 | | | | 12・3 | 京都本能寺日侶、19ヶ条の法度を定む(能書) |
| 1543 | 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | 聖誕322
祖滅262 | 1・3・4・6・8・10 | 2・9 | 好学院日侶、日承に本能寺々務職を譲る(寺書) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | 4・13 | 摂津上牧本澄寺3世大道院日忍寂(過帳) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | 5・3 | 法華浄土両宗徒、その法流の得失を鎌倉に論ず、北条氏康、法華宗徒を捕えて流す(続鑑) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | 6・18 | 北条氏康、三島本覚寺の諸役を免除す(三覚書) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | 8・14 | 会津妙法寺11世日宣寂(過帳) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | 9・12 | 今川義元、寺領安堵状を重須本門寺に与う(寺書) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | 9・13 | 京都本隆寺日映と本成寺日覺と両寺通用の約を結ぶ(両譜・真綱・本綱) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | 11・14 | 摂津尼崎本興寺10世好学院日侶寂65(興譜) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | 11・17 | 伊豆妙泉寺7世日成、三島本覚寺に於て入浴後頓死64(妙泉寺系図) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | 11・20 | 敦賀本勝寺8世日要寂(過帳) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | ・ | 京都妙顕寺10世日堯、尾州に生る(龍略) |
| 天文12年 | 元中9年 | 癸卯 | | | | ・ | 身延13世日傳、西谷に退院す、麓坊はその遺跡なり(延譜) |
| 1544 | 天文13年 | 元中9年 | 甲辰 | | 聖誕323
祖滅263 | 1・2・4・6・7・9・11・⑪・12 | 7・1 | 武蔵新曽妙顕寺12世日定寂(過帳) |
| 天文13年 | 元中9年 | 甲辰 | | | | 7・6 | 保田日我、神仏本地見聞1巻を著す(奥書) |
| 天文13年 | 元中9年 | 甲辰 | | | | 7・20 | 京都妙泉寺4世長生院日春寂(過帳) |
| 天文13年 | 元中9年 | 甲辰 | | | | 10・13 | 鎌倉妙法寺10世一如院日顗寂(過帳) |
| 天文13年 | 元中9年 | 甲辰 | | | | 11・20 | 今川治部大輔、下知状を重須学頭に与う(寺書) |
| 天文13年 | 元中9年 | 甲辰 | | | | 12・1 | 北条氏康、沼津妙海寺に禁制を下す(妙海寺文書)、「天文十三年甲辰極月廿一日寺泊法福寺第十八代正住院日進(花押)」(版本法華経8巻奥書・同寺蔵) |
| 天文13年 | 元中9年 | 甲辰 | | | | 12・21 | 善学院日鏡、身延14世に入山(延譜) |
| 1545 | 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | 聖誕324
祖滅264 | 3・5・6・8・9・11 | 1・20 | 足利晴氏、下総法華経寺を同国法華宗の本寺と為す(寺書) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 2・11 | 保田妙本寺日我、草案1巻を著す(奥書) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 3・ | 越前浅倉孝景、制礼を今宿妙勧寺に下す(制札・同寺蔵) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 4・1 | 佛壽院日現、身延詣書1篇を著す(奥書) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 4・19 | 保田日我、蟇蛇異見抄1巻を著す(奥書) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 5・1 | 越後寺泊法福寺正住院日進寂(過帳) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 7・ | 保田日我、申状見聞1巻を著す(奥書) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 8・2 | 京都法華宗諸寺、公儀より還住の許を受く(隆記・本能寺過去帳)、而して本能寺12世日承、西洞院に於て別に寺地を求め大伽藍を再建、永禄の初めごろまでここに在り(隆記・建表) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 8・ | 武田晴信、沼津本光寺を焼く(八妙記) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 8・ | 駿河岡宮光長寺並に諸坊、武田晴信の為に破却せらる(八妙記) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 9・15 | 広蔵院日辰、北野宮寺内の会所に行き一切経を拝見す、時に38歳(辰伝) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 9・ | 本国寺番神堂再建成る(圀譜) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | 10・ | 身延祖師堂(17間四方棰各2間)造立、同宮殿成る(延建) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | ・ | 身延祖師堂の宮殿造立、施主西ノ房日祐、大蓮房日守、大工池上縫允正重(延譜) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | ・ | 清原氏の名を以て、下総法華経寺に制札を下す(中山古文書) |
| 天文14年 | 元中9年 | 己巳 | | | | ・ | 池上佛壽院日現、学誉天聴に達し権大僧都法印に叙せられ、身延に登詣す(別統) |
| 1546 | 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | 聖誕325
祖滅265 | 1・4・6・8・9・10・12 | 1・7 | 千葉家20代昌胤没(賀過) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 1・7 | 京都本法寺7世智光院日便寂(過帳・霊記) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 1・23 | 保田日我、化儀秘決私記1巻を著す(奥書) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 1・30 | 広蔵院日辰、本門十妙抄2巻を著す(奥書) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 1・ | 日辰、本隆寺日眞の法華論大綱1巻を聴講す(奥書) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 6・17 | 京都本隆寺4世本栖院日映、越前今泉(今の常栖寺)に於て寂59(伝録・真綱) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 7・1 | 尾張上萱津妙勝寺7世日從寂(過帳) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 7・29 | 尾張津島本蓮寺8世日澄寂(過帳) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 8・15 | 感応寺7世開権院日合寂(歴譜) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 8・15 | 日向日知屋の定善寺臼杵院日助、曽我物語10巻を写す(奥書) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 9・17 | 真間弘法寺7世日與寂(過帳) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 9・29 | 朝比奈親徳、富士久遠寺の諸役を免除す(寺書) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 10・26 | 甲斐鏡中条長遠寺11世日尊寂(過帳) |
| 天文15年 | 元中9年 | 丙午 | | | | 12・ | 京都奉行、帰洛あるべき旨を総じて一宗別して京都本国寺に通告す(圀譜) |
| 1547 | 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | 聖誕326
祖滅266 | 2・5・7・⑦・8・9・11・12 | 1・10 | 保田日我、久遠寺置文を同寺代官並に僧俗中に示す(寺書) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 1・24 | 京都妙満寺住侶実行坊日尊、眞門の日諦の寿量品抄19巻を写す(耀記) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 2・ | 京都中の本宗15ヶ寺連署状を平井加賀守並に進藤山城守に呈す(奥書) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 2・ | 京都中の本宗15ヶ寺申定条々書を山門の三院に呈す(奥書) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 4・1 | 幕府、京都妙顕寺に禁制を掲ぐ(顕書) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 5・ | 本宗の諸寺、江州の進藤山城守・平井加賀守に依て、佐々本定頼に申して山門の欝憤を息め、各々寺庵を作らしむ(要祖) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 6・7 | 幕府奉行人等、条件を付して法華宗徒の帰洛を許す(後鑑・室代史・能書) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 6・17 | 京都本能寺・法華寺・本国寺、六角定頼に頼りその京都還住を延暦寺に謝し、和談の条規を定む(能書・古集・集書・両譜) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 7・2 | 日辰、一切経を披覧す、時に40歳(辰伝) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 7・24 | 江戸本行寺開基太田資高、江戸城に卒す、法号万好斎如水道脱日悦、法恩寺に葬る(本行寺日忠記録) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 8・6 | 京都本国寺日助、本堂再興成就、8月7日、本尊遷座に就き勅願所の綸旨を賜う(圀譜) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 8・7 | 後柏原院、本尊遷座の綸旨を本国寺に賜う(圀譜) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 8・10 | 本国寺、本尊遷座式を奉行す(圀譜) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 9・6 | 上総小西正法寺3世日遊寂(平賀歴譜・小西歴譜) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 9・29 | 正法院日沾、撰経を下総中山本妙寺学頭本住律師日自に相伝す(撰経奥書・越後村上経王寺蔵) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | 10・12 | 本国寺日助、同寺の旧地に還住す(圀譜) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | ・ | 武田晴信、法華宗徒の浄土宗との諍論を禁ず(甲鑑) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | ・ | 菩提心院日覺、偏強観破集4巻を著す(奥書) |
| 天文16年 | 元中9年 | 丁未 | | | | ・ | 北条氏康、敷地2貫200文を鎌倉本覚寺に附与す(寺覧) |
| 1548 | 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | 聖誕327
祖滅267 | 2・5・8・9・11・12 | 1・1 | 真如院日賀並に妙存、本国寺日靜造立の両尊を修造す(圀譜) |
| 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | | | 5・28 | 京都本国寺、刹堂を建立す(圀譜) |
| 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | | | 9・6 | 京都本国寺、戒光寺の堂を引て祖師堂とす(圀譜) |
| 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | | | 9・12 | 遠江中村満勝寺16世勧乗院日勝寂(過帳) |
| 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | | | 11・3 | 円龍院日政、京都本国寺の鬼子母神等を造立す(圀譜) |
| 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | | | 11・13 | 住本寺日在、上行・住本両寺合併す(日在掟書) |
| 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | | | 12・11 | 身延隠居日傳寂67(延譜・延鏡・別統) |
| 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | | | 12・14 | 相模鎌倉町より出火、比企ヶ谷妙本寺焼失(現状) |
| 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | | | 12・18 | 南部勝義卒、法号大素清公(延山記) |
| 天文17年 | 元中9年 | 戊申 | | | | ・ | 法華宗と叡山と和解成立して還住の内諾を得たり(霊記・負薪記) |
| 1549 | 天文18年 | 元中9年 | 己丙 | | 聖誕328
祖滅268 | 1・3・6・9・11・12 | 2・21 | 足利義輝、本国寺に詣で所蔵の綸旨に証判を与う(圀書) |
| 天文18年 | 元中9年 | 己丙 | | | | 5・3 | 一如院日重、若狭小浜に生る、心性日遠の叔父(別統・愚案・本遠寺蔵過去帳) |
| 天文18年 | 元中9年 | 己丙 | | | | 6・19 | 武蔵一之江妙覚寺8世日倫寂(過帳) |
| 天文18年 | 元中9年 | 己丙 | | | | 7・3 | 耶蘇宣教師ザビエル、弥次郎の案内でインドのゴアより鹿児島に耶蘇教を伝う(辻表) |
| 天文18年 | 元中9年 | 己丙 | | | | 10・8 | 種子島恵時、宗祖自筆大曼荼羅1幅を種子島本源寺に寄附す(種譜) |
| 天文18年 | 元中9年 | 己丙 | | | | 11・13 | 京都本国寺日助、出雲国富田長満寺常住本尊を与う(尾州萱津実相寺蔵) |
| 天文18年 | 元中9年 | 己丙 | | | | 11・16 | 保田妙本寺日我、富士久遠寺置文を定む(保妙書) |
| 天文18年 | 元中9年 | 己丙 | | | | ・ | ザビエル、山口に大内義隆の許を尋て布教し、城中に仏僧と宗論す(日地名) |