| 1490 | 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | 聖誕269
祖滅209 | 1・3・4・6・8・⑧・9・12 | 1・7 | 甲斐石和遠妙寺9世淳正院日保寂(過帳) |
| 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | | | 3・15 | 鎌倉妙法寺12世日盛寂(過帳・鎌妙記) |
| 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | | | 6・ | この月より円明院日澄、啓運鈔を起稿す(巻14奥書) |
| 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | | | 7・9 | 狩野元信の父正信卒97、京都妙覚寺に葬る(過帳) |
| 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | | | 7・22 | 名古屋本要寺2世十如院日純寂(過帳) |
| 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | | | 8・21 | 京都妙満寺13世心性院日匠寂(過帳) |
| 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | | | 8・28 | 敦賀妙顕寺5世円舜寂(過帳) |
| 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | | | 10・5 | 尼崎本興寺6世金剛院日與、法華和語記4巻を著す(奥書) |
| 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | | | 11・1 | 熱田本遠寺6世廣演院日誓寂(過帳) |
| 延徳2年 | 元中9年 | 庚戌 | | | | 11・ | 慶陽院日悦、本迹勝劣之事を著して一致派を破す(奥書) |
| 1491 | 延徳3年 | 元中9年 | 辛亥 | | 聖誕270
祖滅210 | 1・3・5・6・8・10・12 | 2・18 | 足利義稙、先例に任せて祈禱を本国寺に命ず(布録) |
| 延徳3年 | 元中9年 | 辛亥 | | | | 3・16 | 常陸赤浜妙法寺6世日道寂75(過帳) |
| 延徳3年 | 元中9年 | 辛亥 | | | | 4・1 | 遠江中村満勝寺2世仏種院日住寂(過帳) |
| 延徳3年 | 元中9年 | 辛亥 | | | | 4・19 | 金剛院日與、本興寺を日盛に譲る(譲状・興譜) |
| 延徳3年 | 元中9年 | 辛亥 | | | | 5・4 | 駿河西山本門寺9世日出寂(寺譜) |
| 延徳3年 | 元中9年 | 辛亥 | | | | 6・9 | 京都本能寺金剛院日與寂66(両譜) |
| 延徳3年 | 元中9年 | 辛亥 | | | | 7・18 | 足利義尹、京都本能寺に天下安全の祈禱を命じ同寺領を安堵せしむ(寺書) |
| 延徳3年 | 元中9年 | 辛亥 | | | | 9・13 | 越前今宿妙勧寺元通院日完寂(過帳) |
| 延徳3年 | 元中9年 | 辛亥 | | | | ・ | 身延日朝、補施集179巻を脱稿(身延山蔵正本奥書) |
| 1492 | 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | 7・19 | 聖誕271
祖滅211 | 3・5・6・8・9・11 | 2・2 | 太田道灌の父道眞卒82(別統) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 2・13 | 圓頓房日泰、上総土気善勝寺の落慶式を営む(寺記) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 2・15 | 千葉輔胤卒77(賀過) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 2・18 | 幕府、先例に任せ将軍家の祈禱を京都本国寺に命ず(布録) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | ・ | 春、尾州羽栗法蓮寺祖日妙(身延日朝の弟子、法浄院)尾州に遊化す(別統) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 6・10 | 幕府、法華宗徒の他宗の法を受持せず、また諸勧進を出さざる不受不施公許状を京都本国寺に与う(布録) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 8・4 | 京都本満寺9世日通寂(歴譜) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 8・21 | 幕府は将軍西国着岸に際し京都本国寺の祈禱丹誠の功を賞す(布録) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 9・1 | 千葉勝胤、寺領安堵状を下総真間弘法寺に下す(寺書) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 11・ | 京都妙蓮寺9世常住院日忠、本尊鈔2巻を著す(奥書) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 12・18 | 上総興津妙覚寺11世日滿寂24、先住日眞の資、在住5年(歴譜) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 12・25 | 弘経寺日健、妙覚寺正行院法印日源の撰時抄講談2回(寛正4年、応仁3年)を書合せて筆写了る(撰私奥) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | 12・ | 慶陽院日悦、本迹勝劣追加(一宗決疑鈔)を著して一致派の回答を促す(奥書) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | ・ | 甲州大飢饉、牛馬斃るる事限りなし(八妙記) |
| 延徳4・明応1年 | 元中9年 | 壬子 | | | | ・ | 日澄、法華啓運鈔55巻並に本迹決疑抄2巻を著す(奥書) |
| 1493 | 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | 聖誕272
祖滅212 | 1・4・④・5・7・8・10・11 | 3・23 | 上総興津妙覚寺6世日仙寂29、在住8年、興津生(歴譜) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 3・ | 行学院日朝、尾張黒田法蓮寺法浄房日妙に本尊を授けてその教化を賞す(側書・過帳) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 4・11 | 下総中山浄光院6世日聽寂(過帳) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 4・18 | 高岡妙伝寺祖大覚院日教寂75(別統) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 4・24 | 円明院日澄、経中難問私記1巻を著す(奥書) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 4・29 | 鎌倉浜の法華寺11世仏地院日周寂(歴譜) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 5・ | 京都妙満寺焼く(寺記) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 7・10 | 織田敏定、敷地を萱津実成寺に寄進す(寺書) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 8・1 | 尾張萱津妙勝寺5世日倫寂(過帳) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 8・ | 下旬、佐渡河原田妙経寺8世正住院日應、妙経寺根源記1巻を著す(奥書) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 9・13 | 駿河重須本門寺6世日淨、日圓への譲状を書す(寺書) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | 9・25 | 重須本門寺日淨寂(過帳) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | ・ | 日澄、慶陽院日悦に対し五十六箇条疑難巻を著す(奥書) |
| 明応2年 | 元中9年 | 癸丑 | | | | ・ | 鎌倉管領上杉顕定の計いで法華寺を高倉小路(材木座の内)に移す(玉鑑・史伝) |
| 1494 | 明応3年 | 元中9年 | 甲寅 | | 聖誕273
祖滅213 | 1・4・7・8・10・11・12 | 1・28 | 隆珍、堺の弘通所の家屋敷を房州保田妙本寺日要に寄進す(寺書) |
| 明応3年 | 元中9年 | 甲寅 | | | | 3・18 | 遠江中村満勝寺4世法善院日賀寂(過帳) |
| 明応3年 | 元中9年 | 甲寅 | | | | 5・14 | 京都頂妙寺玉泉坊日宏、本尊相承事1巻を著す(奥書) |
| 明応3年 | 元中9年 | 甲寅 | | | | 7・14 | 円明院日澄、鎌倉妙法寺本堂に於て法華経序品目連の下りより退座一面に至るまでを二七日(14日間)にわたり講談す(啓鈔・奥書) |
| 明応3年 | 元中9年 | 甲寅 | | | | 10・27 | 行学院日朝、弘経要文集7巻を著す(奥書) |
| 明応3年 | 元中9年 | 甲寅 | | | | 12・13 | 越前平井平等会寺4世順盛法印寂(過帳) |
| 明応3年 | 元中9年 | 甲寅 | | | | 12・20 | 本能寺日增を権少僧都に任ず(寺書) |
| 明応3年 | 元中9年 | 甲寅 | | | | ・ | 京都本隆寺日眞、越前武生に弘通し他門勝劣の顕本・本行・上行の3寺を合て本興寺となし、千部読誦を行い本能寺日增・妙蓮寺日宋・妙満寺日崇下向して説法す(本興寺縁起) |
| 明応3年 | 元中9年 | 甲寅 | | | | ・ | 日助、天台より改宗(政家記) |
| 1495 | 明応4年 | 元中9年 | 乙卯 | | 聖誕274
祖滅214 | 2・5・8・10・11・12 | 1・8 | 越後三条本成寺7世筑後阿闍梨菊台房日將寂45(歴譜) |
| 明応4年 | 元中9年 | 乙卯 | | | | 3・5 | 武蔵鐘ヶ淵長昌寺8世日眼寂、在位46年(過帳) |
| 明応4年 | 元中9年 | 乙卯 | | | | 4・ | 京都本能寺日增、関白一条冬良の第に於て法華要品を講讃す(寺書) |
| 明応4年 | 元中9年 | 乙卯 | | | | 7・2 | 京都妙本寺日具、祈禱経を書写す、歳74(岐阜清水覚林寺蔵) |
| 明応4年 | 元中9年 | 乙卯 | | | | 7・6 | 身延日朝、発病す(補奥) |
| 明応4年 | 元中9年 | 乙卯 | | | | 8・15 | 鎌倉に大地震大海嘯ありて、浜の妙法寺堂塔破壊せられて高御倉小路に移る(玉鑑) |
| 明応4年 | 元中9年 | 乙卯 | | | | 9・11 | 名古屋本要寺再興大檀那織田大和守敏定卒、法号は蓮光院殿常英大居士(過帳) |
| 明応4年 | 元中9年 | 乙卯 | | | | 10・25 | 上総宮谷本国寺祖日肝寂(過帳) |
| 明応4年 | 元中9年 | 乙卯 | | | | 11・21 | 細川勝益、敷地を京都頂妙寺に寄進す(其状・寺書・霊記) |
| 1496 | 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | 聖誕275
祖滅215 | 1・②・5・8・10・11・12 | 4・10 | 越後守護上杉房能、日現を本成寺住持職に任ず(寺書) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | 5・ | 甲斐の小西右京公氏、問答用意抄第4巻を写す(奥書) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | 6・24 | 京都妙覚寺・立本寺は、妙蓮寺に於て本能寺・妙蓮寺・妙満寺と本迹の致劣を諍い遂に公裁を仰ぐ(一體録) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | 7・23 | 淡路妙京寺6世日彰寂(過帳) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | 9・21 | 本隆寺日眞、但馬の妙境寺に於て祖書抜書を写す(奥書) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | 9・23 | 織田寛村、敷地安堵状を尾張萱津実成寺に与う(寺書) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | 9・ | 京都妙蓮寺寺務日盈・学頭日亮両人、本門弘経抄を補写す(耀記) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | 10・ | 円教院日意、日像類聚の本迹同一要文集を妙覚寺日享より借用して写す、時に53歳(奥書) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | 11・ | 駿河岡宮光長寺客殿落成、また羅刹堂を造立す(八妙記) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | ・ | 武蔵池上本門寺日現、備前に生る(備由・別統) |
| 明応5年 | 元中9年 | 丙辰 | | | | ・ | 京都妙顕寺日芳、天皇に対し法華講経の砌、紫衣並に緋金紋袈裟等を賜う(寺記) |
| 1497 | 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | 聖誕276
祖滅216 | 2・3・6・9・11・12 | 2・6 | 神道長上卜部兼倶、宗家鎮護勧請の番神に就て難書を作り、本国・妙本・妙蓮3寺に送る(顕書) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 2・9 | 妙蓮寺学頭日忠、兼倶の難問に答う(神興・顕書) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 2・30 | 兼倶再び難問す(顕書) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 2・ | 本国寺内鎮守社務の権少僧都日壽、兼倶に返書を出す、兼倶これを相手にせず(顕書) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 4・ | 日忠、兼倶よりの第2の難問に答う(顕書) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 5・3 | 妙本寺日具、返書を兼倶に致す(龍略) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 5・4 | 兼倶、第3問として6ヶ条の難問を発す、日忠、後半の3ヶ条に就き答う(龍略) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 5・11 | 伊豆法誦山妙泉寺3世日堯寂35(系図・身延山蔵) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 6・ | 越前行光寺日利、身延相伝の観心本尊鈔2巻を写す(奥書) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 8・6 | 行学院日朝の補施集第101巻成る(奥書) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 8・25 | 村松海長寺8世日圓寂(過帳) |
| 明応6年 | 元中9年 | 丁巳 | | | | 9・13 | 岐阜法華寺初祖妙法華院日授寂(過帳) |
| 1498 | 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | 聖誕277
祖滅217 | 2・3・5・7・10・⑩・11 | 1・8 | 京都妙覚寺12世寿量院日享寂75(過帳・霊記) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 2・3 | 江戸平河法恩寺3世日喜寂(過帳) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 3・1 | 京都本国寺11世日堯、日了に職を譲り、尼崎長遠寺に隠栖、時に38歳(圀譜) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 3・28 | 卜部兼倶、賀札を京都妙本寺日具に呈す(寺書) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 5・4 | 佐渡河原田妙経寺7世日應寂70(過帳) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 5・28 | 安房保田妙本寺11世日要、富士一流草案1巻を著す(奥書) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 6・2 | 保田妙本寺第2学頭一条房日朝寂88(当案) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 6・17 | 日本諸州大地震(合運・王覧) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 6・28 | 三河善立寺、安城より領主清康と共に岡崎へ移る(関発之事・同寺蔵・過帳) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 7・14 | 駿河岡宮光長寺5世日用寂(過帳) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 8・25 | 辰刻、大地震、日本国中の堂塔諸家悉く倒壊、大海嘯、身延山諸堂塔悉く崩壊、安房小湊誕生寺流失し坊舎を妙之浦に移す(八妙記・日海記) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 8・26 | 出雲多久大慶寺2世宝光院日報寂83(過帳) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 8・ | 京都妙本寺日具、僧正に任ぜられる(寺書) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | 10・ | この冬雪降らず大飢饉(八妙記) |
| 明応7年 | 元中9年 | 戊午 | | | | ・ | この頃、妙本寺と立本寺との間に和睦の義起りしも、妙本寺先住日具は反対意見を述ぶ(具公状) |
| 1499 | 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | 聖誕278
祖滅218 | 1・2・4・5・7・10・12 | 1・2 | 大地震大風害(八妙記) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 2・ | 京都頂妙寺日祝、御条目1巻を著す(奥書) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 3・15 | 安房保田妙本寺11世日要、上洛上奏(寺書・定善録) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 3・22 | 駿河西山本門寺10世日典、後住の為に置文を書す(寺書) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 3・ | 身延山12世日意、申状を幕府に奉る(奥書) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 5・23 | 下総真間弘法寺6世日隆寂(過帳) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 6・20 | 後土御門天皇、本国寺をして四海安全の祈禱を修せしむ(布録) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 6・24 | 京都妙本寺6世日具、澗亭函底抄3巻を著す(奥書) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 6・ | 京都頂妙寺日祝、門中並に寺門衆徒成敗の為の6ヶ条の条文を定む(寺書) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 7・6 | 叡山3塔9院悉く細川氏の為に焼かる(八妙記) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 7・19 | 幕府、京都立本寺に禁制を掲ぐ(寺書) |
| 明応8年 | 元中9年 | 己未 | | | | 8・25 | 西山本門寺10世日典寂(過帳) |