| 1868 | 明治1 | 2・― | 釈日正，日蓮宗不受不施派公許を新政府に訴える（不受不施派読史年表） |
| 明治1 | 3・13 | 釈日正，日蓮宗不受不施派公許の願書を上弁事達所に提出する（不受不施派読史年表） |
| 明治1 | 4・1 | 池上本門寺，征東大総督有栖川宮・副総督柳原侍従の宿所にあてられる＜～13＞（池上歴代年譜） |
| 明治1 | 4・20 | 中山法華経寺，山門前の民家よりの出火のため山門・遠寿院・智泉院など11カ坊を焼失する（日蓮宗年表） |
| 明治1 | 4・28 | 神宮寺日進，『当家本尊略注』を著わす（奥書） |
| 明治1 | 7・29 | 長松清風，京都にて捕えられ入牢する（法華宗年表） |
| 明治1 | 8・4 | 長松清風出牢後，「捨邪帰正誓状」を京都本能寺に提出し出家する（法華宗年表） |
| 明治1 | 8・7 | 松平頼該没＜60＞讃岐高松八品講の祖（日蓮宗年表） |
| 明治1 | 9・― | 松ケ崎檀林妙真院日敬ら初行3名・再行1名・再々行2名・計6名，遠寿院荒行堂に入行する（両院行僧人名録） |
| 明治1 | 10・18 | 太政官，日蓮宗諸本寺に三十番神など神祇称号の混用禁止を布達する（神仏分離史料） |
| 明治1 | 10・18 | 太政官，三十番神への天照大神等の配祀及び曼荼羅中への天照大神等神号の勧請禁止・経帷子などへの神号筆写禁止につき日蓮宗諸本寺に通達する（神仏分離史料） |
| 明治1 | 10・― | 京都妙顕寺，神号公称の禁止に対し番神堂の特別存置を出願する（日宗龍華年表） |
| 明治1 | 11・12 | 九条日尊寂＜62＞京都村雲瑞龍寺第9世（日蓮宗年表） |
| 明治1 | 11・― | 身延山久遠寺，神仏混淆禁止令発布に対し東京触頭3カ寺名をもって触書を末寺に布達する（身延山史） |
| 明治1 | 12・8 | 諸宗同徳会盟，初めて京都興正寺にて会合し，日蓮宗より朗惺寺・瑞輪寺加盟する（日薩） |
| 1869 | 明治2 | 1・20 | 日蓮宗不受不施派釈日正，日朗菩薩550遠忌を修す（不受不施派読史年表） |
| 明治2 | 1・21 | 京都妙顕寺，日朗菩薩550遠忌を修す（日宗龍華年表） |
| 明治2 | 1・― | 身延山久遠寺，神仏混淆廃止の布令に対し天照・八幡・三十番神等の取扱いに関する触書を末寺宛に発する（身延山史） |
| 明治2 | 2・11 | 飯高檀林の中台谷・松和田谷両学徒，身延山久遠寺に対し僧侶教育改革などの案を提出する（身延山史） |
| 明治2 | 3・20 | 日蓮宗など仏教各宗，連合して耶蘇教禁制を建白する（日蓮宗年表） |
| 明治2 | 3・― | 新居日薩，諸宗同徳会盟に参画する（新居日薩） |
| 明治2 | 4・25 | 新居日薩・河田日因（朗惺寺）・小石川蓮華寺日𨗧，芝増上寺にて開催の諸宗同徳会盟の会議に出席する（新居日薩） |
| 明治2 | 4・― | 小川泰堂，『温泉小記』を著わす（小川泰堂伝） |
| 明治2 | 5・5 | 日蓮宗寺院及び僧侶淘汰論（日蓮宗建言）提出される（日薩） |
| 明治2 | 5・― | 新居日薩，神儒仏三教鼎立論を政府に建白する（日薩） |
| 明治2 | 5・― | 新居日薩，日蓮宗と神道との密接不離を東京池上+A23:D27にて説く（日薩） |
| 明治2 | 6・13 | 三宅島流人僧施王院日妙，大赦により東京に帰る（不受不施派読史年表） |
| 明治2 | 8・25 | 社寺の菊紋章使用禁止につき太政官布告を受理する（日蓮宗法令） |
| 明治2 | 8・― | 水戸三昧堂檀林，廃止される（妙宗年表） |
| 明治2 | 9・― | 身延山久遠寺，教育内容などに関する改正規則を定める（身延山史） |
| 明治2 | 10・18 | 河竹黙阿弥作「花栬高祖御伝記」，東京市村座にて上演される（河竹黙阿弥） |
| 明治2 | 11・― | 日蓮宗不受不施派釈日正，池上本門寺を訪ね宗義允許願への連署を求める（不受不施派読史年表） |
| 明治2 | 12・8 | 永昌院通義日鑑寂＜64＞京都寂光寺22世。説法1万座・『本門顕要抄』などを著述した学僧（日宗龍華年表） |
| 明治2 | 12・11 | 身延山久遠寺，甲州駿河諸末寺廃仏毀釈除の祈禱を修す（みのぶ） |
| 明治2 | 12・― | 受不施派僧，不受不施派日正・日妙の追放を土佐藩主に訴える（不受不施派読史年表） |